地球，
sam：你们来自哪？
擎天柱：三亿多年前的过去，和几百万年后的未来。哈哈
sam：哦天那，看来超出我的理解范围了，这个问题还是以后再问比较合适。
铁皮问sam：你怎么不问我们去哪？
……

水下，威震天确信已死，博派派来的后续战士正在肢解威震天等人。（偶尔还有几个残肢作无力的抵抗）
飞跃：大哥为什么不下令当场肢解这些邪派家伙？
显微镜：在人类看来，这都是死，死是永远都不可逆转的，我们没必要多此一举，激发和引导当时在场那么多人类的理解能力，只能使时空越发不稳定。
转轮：那，我们现在是不是应该装作很害怕状？
飞跃：哈哈
……

因为这是一个新闻自由的社会，所以不论新闻、报纸再怎么宣传变形金刚的故事，百姓们只相信那是媒体们无聊的骗钱手段，博派变形金刚就这样又在地球上默默的存在了20多年。前提是，第八区域的官方支持
……

25年后

宇宙，
震荡波军团凭空显形，军团之大，弥散于银河系中，在遥远的星空，像是雾状的星云，不，更像刚刚爆发的超新星。
震荡波：“架构”还是没能突破中微子……
震荡波变形，太空雷达，然后再变回生物体形态
飞碟（震荡波的手下）：首领，虽然没能发生本质的改变，但起码我们能暂时消灭这个时态的博派。
震荡波：一样的，就像博派已经消灭了威震天一样，这种时空的差距是“架构”给的，不保证我们下一个敌人会是怎样的擎天柱，但是，哈哈，现在的擎天柱必死无疑。


地球，
古生物博物馆，
恐龙模型的身躯巨大，为一劳永逸，所以采用金属材质。
博物馆的正中央是远古病毒的DNA大分子结构模型

宇宙的深处，难听的笑声……

地球，
郊外，

丹尼尔（成年）：我知道有些话你们不方便和我说，其实我也一样……
杯子：这么说，咱们都很悲观。
丹尼尔（很严肃）：其实你不知道，“架构”的主题不是突破，“架构”每突破一次，未来……
此时丹尼尔的话被杯子强行打断。
杯子：哼，年轻人，总是在空想，你知道吗，我这部老汽车经历了几百万年的战斗（杯子按照他自己的想法回忆起几百万年的战斗场面，为了博派的自由，为了维护宇宙的和平）。宇宙中什么奥妙我没经历过？
丹尼尔：那是因为魔方没离开赛波特恩，所以你经历的年代是顺行的！不跟你说了，真不知道你是真糊涂还是装糊涂！

遥远的宇宙，
丹尼尔的话似乎被什么人听到一样
另一块魔方启动，超越无数倍的光速奔往地球。

火星，邪派残留基地。（猎兔犬号的失事与其有不可推卸的关系）
不远处的郧坑，惊破天突现！身后是明显不符合时代特征的其他邪派成员
邪派战士机器昆虫组合惊讶不已。
大火车：大家安静，威震天没突破“架构”……
机器昆虫：那就是说，这家伙依然是我们的首领？
瞬间，惊破天与邪派残留战士之间出现原代码链条数据墙（实际用情节表示出来就是几亿年的星际战争和所有高等文明中的尔虞我诈，但是都是瞬间的图形象告诉幻灯片那样），彼此胸前的邪派图腾标志寒光闪烁，显然，惊破天成为新一代邪派首领。原代码链条数据墙传播到遥远的宇宙。
一场腥风血雨即将卷土重来
宇宙中一个丧心病狂的极有穿透力的嗓音叫喊着：我叫惊破天，我要消灭博派！


地球，
古生物博物馆。
讲解员：……远古病毒确实可怕，它们对同一物种的打击有可能是毁灭性的，但是，随着被寄宿物种的灭绝，病毒也随之以各种形式销声匿迹……

魔方降临
瞬间，所有金属材质古生物模型拥有生命。
以霸王龙为首，所有古生物模型摆脱展台，走上大街。
新闻界再次爆炸
一个史前时代博物馆被赋予生命了
博派机器人在擎天柱的率领下前往拜访古生物机器人。
其实，虽然这些史前生物面目狰狞，但是并没对人类造成什么危害。


Sam：魔方又来了，擎天柱。别和我说它也来自3亿年前和几百万年后。
擎天柱：不，没有人希望战争，威震天也是。90年前的人类没有能力冻结他。
Sam：但是当时已经有战斗机了，而威震天再早几十年降临地球的话很可能变身蒸汽火车形态，不是么？就像这些机器恐龙，他们也生活在3亿多年前，而3亿多年前就肯定有货车么？
此时，
机器恐龙为首的霸王龙发现机器人形态的擎天柱，彼此之间出现原代码链条数据墙，机器恐龙胸前惊现博派图腾标志。之后霸王龙走开，四周出现强烈的原代码链条数据墙能量源，所有史前生物回归博派。
擎天柱：魔方是生命之源，也是战争之源，邪恶魔方在这个时代被摧毁了，远古和未来的魔方依然对现在有衍射力。依然会召唤时空断层中的力量来弥补这个时代的邪恶之源。
Sam：天那，又超出我的理解能力了，但是这次是反向的，还好我学过导数和微积分，哈哈，如果哪天机器人都不相信科学了，人类肯定早已失去了幻想。
擎天柱：等我打败新威震天之后再向你解释吧，博派机器人们，变形出发，打败邪派。


以地球总部为核心的博派和宇宙中的邪派在外太空开始了一场规模空前的战役。
打斗中，（肉搏，因为长距离制导武器可以受信号干扰，搞不好就炸自己人）
擎天柱一拳：威震天，你不该以这种形态出现在这个时代，你知道这样做的后果么？
惊破天一脚：你不觉得你在自欺欺人么？还有，我现在叫惊破天，一会就能消灭你！

千斤顶：震荡波，不伦不类的外形并不能掩饰你的丑陋！
震荡波：哈哈，看来你嫉妒了，这次架构的量变给我们的时代差距至少有100年，100年，什么概念，你已经死了！
千斤顶：证明你虚度了100年！

飞碟：原始的家伙，难怪你们和恐龙为伍！
飞跃：原始？那你不是在说自己退化？从未来来的不要脸的家伙！

……

太空肉搏

……

双方损失惨重，由于时代的差距，原生博派人物损失最大，但由于原始生物机器人的参与将战争持平……

“都走吧”很低沉，但是很浑厚的一个声音，发自宇宙的各处，“因为我没有选择的权力……我不希望这场战争因为我的参与对架构有所冲击”

两派瞬间失去战斗力，无奈中各自回转
地球，
擎天柱对为首的霸王龙说：可以叫你钢索么？带我回地球……（因为重伤声音已经很微弱）
被毁坏的博物馆，
擎天柱（已经不能直立）：看来我错了，sam是对的，时空的差距有时是逆行的……
钢索：只要不破坏中微子记忆体，依赖你们当前的科技，至少能使你软复原……
擎天柱：不，这里是地球，地球的文明还没到这个程度……我们不能因为一己之私而强行拉拽时空差距
旁边奄奄一息的千斤顶：如果这是一个轮回的话，我们已经完成任务了，威震天已经被我们消灭，惊破天已经被我们重创，邪恶魔方也已经在这个时代消融……

时空里暗淡的博派图腾标志……

擎天柱：通天晓，你和钢索一起，看护好现在这块魔……

……
悲痛之后……
通天晓：威震天当初宁可被科技落后的人类冰冻，也不使用魔方，还要隐匿魔方和自己的坐标，我们应该做些什么呢……
显微镜：惊破天不该来得这么快，还有震荡波，之前他没被消融过，怎么会与惊破天同时出现。
大黄蜂：大哥说过，也许威震天也不希望战争……
那个低沉的声音：结束战争也许会对架构造成难以估量的冲击……威震天不是傻子，他也做出了牺牲……
瞬间，天空中出现海市蜃楼，主题是邪派残余部队正在修整。
无力再战的邪派，
红蜘蛛（威震天时代战士）：如果我们全都同时死掉，之后架构再有质变的突破，这样做有意义么？
惊天雷（威震天时代战士）：我觉得有人希望我们这样做……
声波（威震天时代战士）看了看伤重的惊破天：也许威震天勉强算逃出了，也许马上就是重伤的擎天柱，20多年的差距在坐标轴上应该算作一个点。
大火车（威震天时代战士）：博派没有任何和我们相提并论的切入点，不是因为架构，战斗简直就是抬举他们。
震荡波（没经过消融凭空产生时代差距，外形介于威震天时代与惊破天时代之间）：还有就是做好长时间与博派战斗的准备，不，我们必须统治宇宙。
瘟疫（和惊破天同一个时代特征的战士，伤不太重）：对，我们必须统治宇宙，不受任何人指使，这样才能还原另一个的架构，任何手段！
低沉的声音：包括出卖自己的灵魂么？我可以瞬间修复你们，并同时修复所有博派，继续对抗，继续战争，来一个假设吧，我想指使你们，架构质变之后对我有什么好处？
……
红蜘蛛和瘟疫同时说：你应该去3亿（9百万）年之前（后）。
重伤的惊破天变形，粒子炮，消灭此两人：邪派的事不用你管！要么你消灭我，要么你加入邪派！
低沉的声音：那么看来我给你们添麻烦了……
低沉的声音消失……


丹尼尔：杯子，你还想继续隐瞒下去么？擎天柱除了性命还牺牲了什么？
补天士：说吧，杯子，魔方，战斗，架构，变形金刚，这个星球的命运已经离不开这几件事物了。
低沉的声音：你让他说什么？他又有能力说出什么？……
众人抬头
镜头转向博物馆中央的空空如也的病毒架构展台
……
低沉的声音：魔方从来都是对的，架构也是，存在即合理，但是这次魔方似乎犯了个错误，他不该给我生命，我就是古代病毒……如果那是架构的主题，那么魔方的行为将陷入悖论，某种意义上说，我就是死亡和长眠，现在知道为什么我暂时阻断这场战争了吧